Chráněná krajinná oblast Třeboňsko je jedna z mála chráněných lokalit v oblasti po staletí kultivované člověkem. I přes zásahy člověka se zde zachovaly nesmírně cenné přírodní hodnoty. CHKO má rozlohu 700 km čtverečních.
Jedná se o oblast jihovýchodní části Čech u hranic s Rakouskem, převážně na území okresu Jindřichův Hradec a částečně na okresech Tábor a České Budějovice.

Třeboňsko je od roku 1977 jednou ze šesti českých biosférických rezervací programu Člověk a biosféra (MAB) UNESCO. Je příkladem souladu zájmů ochrany přírody a hospodářských aktivit.
V roce 1990 byla reprezentativní část rybníků a na ně navazujících mokřadních biotopů zapsána jako mokřad mezinárodního významu podle Ramsarské konvence pod názvem Třeboňské rybníky. Druhým mokřadním územím Třeboňska spadajícím pod Ramsarskou konvenci jsou Třeboňská rašeliniště. Třeboňsko je rovněž zařazeno do mezinárodní sítě území dlouhodobého ekologického výzkumu.

Na území CHKO Třeboňsko se vyskytuje asi 400 druhů vzácných rostlin, mnoho z nich velmi ohrožených. Najdeme tu mnoho druhů původních jehličnatých i listnatých stromů, mezi které patří borovice lesní a borovice blatka, které vytvářejí unikátní rašelinné lesy.
Na Třeboňsku roste černýš český, koniklec jarní, třtina chloupkatá, svízel lesní, lilie zlatohlavá, vzácné kapradiny a mnoho dalších.

Systém rybníků je významným evropským hnízdištěm a migrační zastávkou vodního ptactva. Zimuje tu orel mořský. Z ptáků žije na Třeboňsku hohol severní, husa velká, labuť, bukač velký, kvakoš noční, různé volavky, strakapoudi, ledňáčci, čáp bílý a další. Na Třeboňsku hnízdí celkem osm druhů sov.

Krajinu Třeboňska člověk začal přetvářet už ve 12. století úpravami vodních poměrů původní močálovité krajiny. Vybudoval tu síť umělých stok a množství rybníků, které udělaly z Třeboňska rybníkářskou oblast. Naštěstí ale hospodářská činnost ani za 800 let osídlení nezničila původní biotopy, i když některé druhy rostlin i živočichů samozřejmě z krajiny mizí.

Kraj je také znám zachovalou unikátní architekturou a má rovněž význam turistický a rekreační. Právě proto by se ochraně přírody Třeboňska měla věnovat velká pozornost.