Eduard Babák se narodil 8. 6. 1873 ve Smidarech. Studoval na gymnáziu v Jičíně, v roce 1898 dokončil studia na české lékařské fakultě v Praze. Od roku 1899 byl asistentem fyziologického ústavu. Roku 1903 se habilitoval na lékařské fakultě v Praze, v roce 1907 se stal mimořádným profesorem.

V letech 1903 a 1906 vykonal delší vědecké cesty v cizině. Od roku 1919 pracoval na Lékařské fakultě Masarykovy univerzity a na Vysoké škole veterinární v Brně. Nesmírně se zasloužil o úspěšné založení a skvělou úroveň těchto vysokých škol.

Byl stoupencem názoru, že všechny fyziologické a psychické děje řídí jedna centrální životní síla. V celém světě proslul svými výzkumy mechaniky a inervace dýchání a účinků kyslíku v tělovém hospodářství. Napsal mnoho prací o vzniku a vývoji tkání, orgánů a orgánových systémů. Nejznámější je jeho dvousvazková příručka fyziologie Tělověda, která vyšla roku 1925.

Věnoval se také popularizaci vědy a byl zakladatelem a redaktorem přírodovědeckých časopisů Příroda, Akvaristické listy a Biologické listy.

Eduard Babák zemřel 30. 5. 1926 v Brně.